MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 90597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009633	A	6	6	180965	180970	100 %	0 %	0 %	0 %	150388009
3003	NC_009633	TAAA	2	8	181022	181029	75 %	25 %	0 %	0 %	150388009
3004	NC_009633	GAA	2	6	181066	181071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388009
3005	NC_009633	CAG	3	9	181196	181204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388009
3006	NC_009633	CCTT	2	8	181205	181212	0 %	50 %	0 %	50 %	150388009
3007	NC_009633	AAT	2	6	181229	181234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388009
3008	NC_009633	A	6	6	181465	181470	100 %	0 %	0 %	0 %	150388010
3009	NC_009633	ATTT	2	8	181491	181498	25 %	75 %	0 %	0 %	150388010
3010	NC_009633	CTTT	2	8	181535	181542	0 %	75 %	0 %	25 %	150388010
3011	NC_009633	ATT	3	9	181558	181566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
3012	NC_009633	TAT	2	6	181585	181590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
3013	NC_009633	CTA	2	6	181615	181620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388010
3014	NC_009633	A	6	6	181673	181678	100 %	0 %	0 %	0 %	150388010
3015	NC_009633	AGG	2	6	181695	181700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388010
3016	NC_009633	TCTAT	2	10	181729	181738	20 %	60 %	0 %	20 %	150388010
3017	NC_009633	GTA	2	6	181801	181806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388010
3018	NC_009633	T	6	6	181855	181860	0 %	100 %	0 %	0 %	150388010
3019	NC_009633	TGC	2	6	182007	182012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388010
3020	NC_009633	TA	3	6	182073	182078	50 %	50 %	0 %	0 %	150388010
3021	NC_009633	A	6	6	182089	182094	100 %	0 %	0 %	0 %	150388010
3022	NC_009633	CAA	2	6	182141	182146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388010
3023	NC_009633	GCA	2	6	182314	182319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388010
3024	NC_009633	GT	3	6	182444	182449	0 %	50 %	50 %	0 %	150388010
3025	NC_009633	CAT	2	6	182451	182456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388010
3026	NC_009633	CAG	2	6	182468	182473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388010
3027	NC_009633	TAT	2	6	182513	182518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
3028	NC_009633	AGCC	2	8	182528	182535	25 %	0 %	25 %	50 %	150388010
3029	NC_009633	TTC	2	6	182554	182559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388010
3030	NC_009633	TAT	2	6	182573	182578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
3031	NC_009633	TGA	2	6	182651	182656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388010
3032	NC_009633	AGC	2	6	182724	182729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388010
3033	NC_009633	TGG	2	6	182741	182746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388010
3034	NC_009633	GGC	2	6	182757	182762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150388010
3035	NC_009633	TTAT	2	8	182945	182952	25 %	75 %	0 %	0 %	150388010
3036	NC_009633	GAT	2	6	182989	182994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388010
3037	NC_009633	TTA	2	6	183001	183006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
3038	NC_009633	GAA	2	6	183036	183041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388010
3039	NC_009633	TGA	2	6	183050	183055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388010
3040	NC_009633	GTT	2	6	183191	183196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388011
3041	NC_009633	GAA	2	6	183248	183253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
3042	NC_009633	ATG	2	6	183305	183310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
3043	NC_009633	CAA	2	6	183371	183376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388011
3044	NC_009633	TTAA	2	8	183377	183384	50 %	50 %	0 %	0 %	150388011
3045	NC_009633	A	6	6	183383	183388	100 %	0 %	0 %	0 %	150388011
3046	NC_009633	TGA	2	6	183391	183396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
3047	NC_009633	TGGA	2	8	183474	183481	25 %	25 %	50 %	0 %	150388011
3048	NC_009633	TGG	2	6	183489	183494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388011
3049	NC_009633	AGA	2	6	183508	183513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
3050	NC_009633	ATC	2	6	183542	183547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388011
3051	NC_009633	TAT	2	6	183602	183607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388011
3052	NC_009633	GAT	2	6	183608	183613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
3053	NC_009633	ATTC	2	8	183727	183734	25 %	50 %	0 %	25 %	150388011
3054	NC_009633	A	8	8	183753	183760	100 %	0 %	0 %	0 %	150388011
3055	NC_009633	AAT	2	6	183773	183778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388011
3056	NC_009633	GAA	2	6	183869	183874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
3057	NC_009633	TGA	2	6	183898	183903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
3058	NC_009633	AGA	3	9	183922	183930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
3059	NC_009633	GA	3	6	183980	183985	50 %	0 %	50 %	0 %	150388011
3060	NC_009633	AAGA	2	8	184112	184119	75 %	0 %	25 %	0 %	150388011
3061	NC_009633	TCAA	2	8	184144	184151	50 %	25 %	0 %	25 %	150388011
3062	NC_009633	TGA	2	6	184182	184187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
3063	NC_009633	CAAG	2	8	184213	184220	50 %	0 %	25 %	25 %	150388011
3064	NC_009633	AAG	2	6	184323	184328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
3065	NC_009633	TAC	2	6	184362	184367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388011
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3068	NC_009633	GAA	2	6	184490	184495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
3069	NC_009633	A	8	8	184520	184527	100 %	0 %	0 %	0 %	150388011
3070	NC_009633	AAT	2	6	184530	184535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388011
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3072	NC_009633	AAG	2	6	184697	184702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388012
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3074	NC_009633	TAG	2	6	184776	184781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388012
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3076	NC_009633	A	6	6	184908	184913	100 %	0 %	0 %	0 %	150388012
3077	NC_009633	TAA	2	6	184922	184927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388012
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3079	NC_009633	ATT	2	6	185006	185011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388013
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3085	NC_009633	GAAAT	2	10	185371	185380	60 %	20 %	20 %	0 %	150388014
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3088	NC_009633	CCA	2	6	185429	185434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388014
3089	NC_009633	AAG	2	6	185435	185440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388014
3090	NC_009633	GCA	2	6	185445	185450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388014
3091	NC_009633	GATG	2	8	185496	185503	25 %	25 %	50 %	0 %	150388014
3092	NC_009633	ATG	2	6	185522	185527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388014
3093	NC_009633	AAGCA	2	10	185533	185542	60 %	0 %	20 %	20 %	150388014
3094	NC_009633	TAGA	2	8	185573	185580	50 %	25 %	25 %	0 %	150388014
3095	NC_009633	GTG	2	6	185620	185625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388014
3096	NC_009633	ATG	2	6	185637	185642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388014
3097	NC_009633	ATTG	2	8	185840	185847	25 %	50 %	25 %	0 %	150388015
3098	NC_009633	GCT	2	6	185868	185873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388015
3099	NC_009633	AAC	2	6	185920	185925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388015
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3101	NC_009633	GA	3	6	185998	186003	50 %	0 %	50 %	0 %	150388015
3102	NC_009633	AG	3	6	186006	186011	50 %	0 %	50 %	0 %	150388015
3103	NC_009633	AGA	2	6	186020	186025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388015
3104	NC_009633	TGG	2	6	186040	186045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388015
3105	NC_009633	GAA	2	6	186072	186077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388015
3106	NC_009633	AGC	2	6	186083	186088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388015
3107	NC_009633	TTA	2	6	186124	186129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388015
3108	NC_009633	GAA	3	9	186201	186209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388015
3109	NC_009633	ACC	2	6	186240	186245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388015
3110	NC_009633	CCATGC	2	12	186293	186304	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150388015
3111	NC_009633	AAG	2	6	186328	186333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388015
3112	NC_009633	ACC	2	6	186356	186361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388015
3113	NC_009633	TA	3	6	186363	186368	50 %	50 %	0 %	0 %	150388015
3114	NC_009633	AAG	2	6	186394	186399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388015
3115	NC_009633	GGA	2	6	186404	186409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388015
3116	NC_009633	ATT	2	6	186447	186452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388015
3117	NC_009633	CGGG	2	8	186524	186531	0 %	0 %	75 %	25 %	150388015
3118	NC_009633	AGT	2	6	186726	186731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388015
3119	NC_009633	A	7	7	186872	186878	100 %	0 %	0 %	0 %	150388016
3120	NC_009633	GAT	2	6	187043	187048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388016
3121	NC_009633	ATG	2	6	187283	187288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388017
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3123	NC_009633	CGA	2	6	187323	187328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388017
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3490	NC_009633	GAA	2	6	207036	207041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388028
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